申請農(nóng)機(jī)合作社與申請一般農(nóng)民合作社程序是一樣的，過程如下：
　　依法登記是農(nóng)民專業(yè)合作社開展生產(chǎn)經(jīng)營活動(dòng)并獲得法律保護(hù)的重要依據(jù)。根據(jù)《農(nóng)民專業(yè)合作社法》第十三條規(guī)定，設(shè)立農(nóng)民專業(yè)合作社，應(yīng)當(dāng)向工商行政管理部門提交相關(guān)文件，申請?jiān)O(shè)立登記。
　　根據(jù)《農(nóng)民專業(yè)合作社法》第十三條規(guī)定，農(nóng)民專業(yè)合作社的設(shè)立人申請?jiān)O(shè)立登記的，應(yīng)當(dāng)向登記機(jī)關(guān)提交的文件有：（一）登記申請書；（二）全體設(shè)立人簽名、蓋章的設(shè)立大會(huì)紀(jì)要；（三）全體設(shè)立人簽名、蓋章的章程；（四）法定代表人、理事的任職文件及身份證明；（五）出資成員簽名、蓋章的出資清單；（六）住所使用證明；（七）法律、行政法規(guī)規(guī)定的其他文件。需要特別注意的是，農(nóng)民專業(yè)合作社向登記機(jī)關(guān)提交的出資清單，只要有出資成員簽名、蓋章即可，無需其他機(jī)構(gòu)的驗(yàn)資證明。
　　申請登記的文件是農(nóng)民專業(yè)合作社顯示組織合法存在的證明，也是成員資格和權(quán)利有效存在的重要證明，其真實(shí)可靠性是保證社會(huì)交易的必然要求。《農(nóng)民專業(yè)合作社法）第五十五條規(guī)定，農(nóng)民專業(yè)合作社向登記機(jī)關(guān)提供虛假登記材料或者采取其他欺詐手段取得登記的，由登記機(jī)關(guān)責(zé)令改正廠清節(jié)嚴(yán)重的，撤銷登記。
　　登記程序由申請、審查、核準(zhǔn)發(fā)照以及公告等幾個(gè)階段組成。《農(nóng)民專業(yè)合作社法》第十三條規(guī)定東方紅1504拖拉機(jī)，農(nóng)民專亞合作社登記辦法由國務(wù)院規(guī)定，并明確辦理登記不得收取費(fèi)用。根據(jù)法律實(shí)施同步有效性的要求，農(nóng)民專業(yè)合作社的登記辦法也將于2007年7月1日與《農(nóng)民專業(yè)合作社法》同步實(shí)施。
　　為了保證登記事項(xiàng)的及時(shí)有效，維護(hù)農(nóng)民專業(yè)合作社及其交易相對人的合法權(quán)益，穩(wěn)定社會(huì)交易環(huán)境，《農(nóng)民專業(yè)合作社法》明確規(guī)定了農(nóng)民專業(yè)合作社法定登記事項(xiàng)變更的，應(yīng)當(dāng)申請變更登記。法定登記事項(xiàng)變更，主要是指：經(jīng)成員大會(huì)法定人數(shù)表決修改章程的；成員及成員出資情況發(fā)生變動(dòng)的；法定代表人、理事變更的；農(nóng)民專業(yè)合作社的住所地變更的；以及法律法規(guī)規(guī)定的其他情況發(fā)生變化的。這些登記事項(xiàng)是對農(nóng)民專業(yè)合作社的存在和經(jīng)營影響很大的事項(xiàng)，直接影響著交易活動(dòng)的正常開展和交易相對方的合法權(quán)益。如果農(nóng)民專業(yè)合作社沒有按照有關(guān)登記辦法和規(guī)定進(jìn)行變更登記，則須承擔(dān)由此產(chǎn)生的法律后果。除法定變更事項(xiàng)外，合作社可以根據(jù)自身發(fā)展需要和情形對相關(guān)登記事項(xiàng)進(jìn)行變更，以保證自身的正常發(fā)展以及維護(hù)交易相對人的知情權(quán)。
　　《農(nóng)民專業(yè)合作社法》對登記機(jī)關(guān)受理登記后的時(shí)間作出了明確限制，即登記機(jī)關(guān)應(yīng)當(dāng)自受理登記申請之白起二十日內(nèi)辦理完畢。這里的登記申請，包括了設(shè)立登記、變更登記和注銷登記等，即從登記機(jī)關(guān)受理登記申請之日起開始計(jì)算，所有的登記工作應(yīng)當(dāng)在二十個(gè)工作日內(nèi)辦理完畢。(主要依據(jù)《中華人民共和國農(nóng)民專業(yè)合作社法》第二章，設(shè)立和登記；《農(nóng)民專業(yè)合作社登記管理?xiàng)l例》第三章，設(shè)立登記）申辦合作社，共涉及工商、公安、稅務(wù)、質(zhì)監(jiān)、銀行 農(nóng)業(yè)等多個(gè)部門。
　　首先：工商行政管理局設(shè)立登記， 提交材料：1、設(shè)立登記申請書;2、全體設(shè)立人簽名、蓋章的設(shè)立大會(huì)紀(jì)要;3、全體設(shè)立人簽名、蓋章的章程;4、法定代表人、理事的任職文件和身份證明;5、全體出資成員簽名、蓋章予以確認(rèn)的出資清單;6、法定代表人簽署的成員名冊和成員身份證明復(fù)印件;7、住所使用證明;8、指定代表或者委托代理人的證明;9、合作社名稱預(yù)先核準(zhǔn)申請書;10、業(yè)務(wù)范圍涉及前置許可的文件。不收任何費(fèi)用。
　　第二：公安局制定刻章 ， 提交材料：合作社法人營業(yè)執(zhí)照復(fù)印件、法人代表身份證復(fù)印件、經(jīng)辦人身份證復(fù)印件。 收費(fèi)400元上下。
　　第三：質(zhì)量技術(shù)監(jiān)督局辦理組織機(jī)構(gòu)代碼證 ， 提交材料：1、合作社法人營業(yè)執(zhí)照副本原件及復(fù)印件一份;2、合作社法人代表及經(jīng)辦人身份證原件及復(fù)印件一份;3、如受他人委托代辦的，須持有委托單位出具的代辦委托書面證明。 收費(fèi)內(nèi)容：108元/證，工本費(fèi)：正本每份10元，副本每份8元;技術(shù)服務(wù)費(fèi)90元。
　　第四：、地方稅務(wù)局申領(lǐng)稅務(wù)登記證 ， 提交材料：1、法人營業(yè)執(zhí)照副本及復(fù)印件;2、組織機(jī)構(gòu)統(tǒng)一代碼證書副本及復(fù)印件;3、法定代表人(負(fù)責(zé)人)居民身份證或者其他證明身份的合法證件復(fù)印件;4、經(jīng)營場所房屋產(chǎn)權(quán)證書復(fù)印件;5、成立章程或協(xié)議書復(fù)印件。免收稅務(wù)登記工本費(fèi)。
　　第五：辦理銀行開戶和賬號(hào) ， 提交材料：1、法人營業(yè)執(zhí)照正、副本及其復(fù)印件;2、組織機(jī)構(gòu)代碼證書正、副本及其復(fù)印件;3、農(nóng)民專業(yè)合作社法定代表人的身份證及其復(fù)印件;4、經(jīng)辦人員身份證明原件、相關(guān)授權(quán)文件;5、稅務(wù)登記證正、副本及其復(fù)印件;6、合作社公章和財(cái)務(wù)專用章及其法人代表名章。不收費(fèi) 。
　　第六：當(dāng)?shù)剞r(nóng)經(jīng)主管部門備案，提交材料：1、法人營業(yè)執(zhí)照復(fù)印件;2、組織機(jī)構(gòu)代碼證書復(fù)印件;3、農(nóng)民專業(yè)合作社法定代表人的身份證復(fù)印件;4、稅務(wù)登記證正、副本復(fù)印件。

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